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离子交换剂通常是一种不溶性高分子化合物 ，如树脂 ，纤维素，葡聚糖 ，醇脂糖等 ，它的分子中含有可解离的基团，这些基因在水溶液中能与溶液中的其它阳离子或阴离子起交换作用 。虽然交换反应都是平衡反应，但在层析柱上进行时 ，由于连续添加新的交换溶液 ，平衡不断按正方向进行，直至完全。
因此可以把离子交换剂上的原子离子全部洗脱下来 ，同理 ，当一定量的溶液通过交换柱时，由于溶液中的离子不断被交换而波度逐减少 ，因此也可以全部被交换并吸附在树脂上 。如果有两种以上的成分被交换吸着在离子交换剂上 ，用洗脱液洗脱时，在被洗脱的能力则决定于各自洗反应的平衡常数 。蛋白质的离子交换过程有两个阶段──吸附和解吸附。吸
附在离子交换剂上的蛋白质可以通过改变pH使吸附的蛋白质失去电荷而达到解离但更多的是通过增加离子强度 ，使加入的离子与蛋白质竞争离子交换剂上的电荷位置 ，使吸附的蛋白质与离子交换剂解开 。不同蛋白质与离子交换剂之间形成电键数目不同，即亲和力大小有差异 ，因此只要选择适当的洗脱条件便可将混合物中的组分逐个洗脱下来 ，达到分离纯化的目的 。
离子色谱法基本原理是离子色谱法?(ion chromatography, IC) ，是高效液相色谱法的一种，是分析离子的一种液相色谱法。
离子色谱法是以低交换容量的离子交换树脂为固定相对离子性物质进行分离, 用电导检测器连续检测流出物电导变化的一种色谱方法。阳离子色谱柱是高效液相色谱的一种 ，是分析阴阳离子的一种液相色谱方法 ，该方法具有选择性好、灵敏 、快速 、简便等优点，并且可以同时测定多种组分 。
树脂上分布有固定的带电荷的基团和能游动的配位离子 。当样品加入离子交换色谱往后 ，如果用适当的溶液洗脱 ，样品离子即与树脂上能游动的离子进行交换，并且连续进行可逆交换吸附和解吸 ，最后达到吸附平衡。
目前 ，离子色谱法已经在能源、环境 、冶金 、电镀、半导体 、水文地质等方面广泛应用，并且开始进入了与生命科学有关的分析领域 。我国从80年代初期引进离子色谱仪 ，开始了离子色谱的应用研究工作 ，同时也开始了仪器的研制，目前已能生产离子色谱仪 。随着离子色谱技术的发展 ，离于色谱仪在我国的应用将日益普及。
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